Titre original : Children of The Gods

Ecrit par : Jonathan Glassner & Brad Wright

Réalisé par : Mario Azzopardi

Un an après avoir pris sa retraite, le Colonel Jack O'Neill est recontacté par la base de Cheyenn Mountain. La porte des étoiles a été réactivée de l'extérieur par des aliens qui ont tués les hommes qui surveillaient la porte et enlevés la femme qui était de service avec eux. L'un des aliens ressemblait à Râ, ce qui amène la question de savoir si il est bien mort. Le Général Hammond, successeur du Général West sur le programme porte des étoiles ordonne l'envoi d'une bombe sur Abydos, le Colonel O'Neill parvient à l'en dissuader et lui avoue que Daniel Jackson, qui était membre de la première équipe d'exploration, était toujours vivant.

O'Neill prend alors le commandement de l'équipe qui partira pour Abydos, cette équipe étant composée de Kawalski, Ferretti et du Capitaine Samantha Carter.Arrivé sur Abydos, l'équipe retrouve Daniel Jackson ainsi que sa femme, Sha're et O'Neill retrouve Skaa'ra , un jeune homme que O'Neill aime comme son fils.

Daniel Jackson emmène l'équipe dans une salle et la décrit comme une immense carte de la galaxie, regroupant les coordonnées de tous les mondes connus de Râ et de ses semblables. Pendant que O'Neill, Carter, Kawalski et Jackson regardaient les symboles qui ornaient les murs de cette immense salle, la porte des étoiles est activée par le même alien qui s'est rendu sur Terre, il fait tué tous ceux qui tentent désespéremment de lui résister et enlève Sha're et Skarra. Ferretti, gravemment blessé pendant la bataille a réussi à voir les coordonnées de la planète de destination de l'alien.

Toute l'équipe rentre sur Terre pour soigner les blessés et grace aux informations que Ferretti a pû donner, SG-1, commandée par O'Neill et SG-2, commandée par Kawalski se rendent sur Chulak. Là, ils se rendent compte que Sha're est devenue la reine de l'alien, connu sous le nom d'Apophis. Il appartient à une espèce de parasite qui prend des humains comme hôtes: les Goa'ulds. Enfermée avec de nombreux autres prisonniers, l'équipe SG-1 fait la connaissance de Teal'c,le bras droit d'Apophis, qui se rend dans cette prison accompagné par d'autres Goa'ulds venus pour choisir les enfants des dieux. Skaara fut choisi et lorsque le choix des enfants fut terminé, Apophis donna l'ordre de tuer tous les autres. C'est alors que Teal'c retourna son arme contre les siens et se mis au côté de SG-1 pour libérer les prisonniers. Mais ils doivent faire vite, car le temps qui leur était imparti avant la fermeture définitive de la porte terrienne est presque écoulé. Après avoir dû affronter un vaisseau de la mort Goa'uld, tout le monde est évacué sur Terre pour être ensuite renvoyé sur leur planète d'origine.